Bo-Katan Kryze est née sur Mandalore durant la période de la République Galactique. Elle est issue d’une famille de hauts dignitaires de cette planète. Sa soeur, Satine Kryze, a été duchesse de Mandalore jusqu’en 19 avBY. A cause du titre de sa soeur, Bo-Katan a eu des relations litigieuses avec elle, car elle a oublié ses origines guerrières (le clan Kryze était réputé comme seigneur de guerre au départ).
Pour contester la nouvelle autorité de sa soeur, Bo-Katan a fait partie de plusieurs organisations contre le pouvoir mandalorien durant la guerre des clones. Elle a notamment fait partie de l’organisation terroriste de la Death Watch, en étant la seconde du chef de guerre, Pre Vizla. Après la mort de ce dernier dû à une mauvaise alliance avec Dark Maul, elle quitte le groupe pour s’opposer à l’ancien seigneur qui a reprit le contrôle du groupe grâce à quelques fidèles.
Dans le même temps, Maul réussi à prendre le contrôle de la planète entière, en tuant la duchesse Satine. en tuant VIzla il récupère au passage le sabre noir, qui lui permet la soumission d’une grande partie de la Death Watch.
Jusqu’à la fin de la guerre des clones, elle réussit à rallier de nombreux alliés, dont certains de grande envergure. C’est par exemple le cas de l’ancienne Jedi Ahsoka Tano, avec qui elle mène de nombreuses opérations contre le Collectif des Ombres de Maul, qui s’est aussi formé une multitude d’alliances. Ces différentes offensives contre le gouvernement du Zabrak ménneront au siège entier de la planète. Le camp de Bo-Katan fût soutenu par la République, qui a envoyé la 332 ème légion (qui est une faction de clones de la 501 ème) pour soutenir Ahsoka Tano. Ils finissent pas stopper les agissements du clan Saxon, allié à l’ancien seigneur Sith, puis après un combat dans la salle du palais, le dirigeant du Collectif des Ombres.
Une fois la menace éliminé Bo-Katan repris le pouvoir qui lui revenait de droit. Mais ce fût de courte durée car l’Empire galactique a été mis en place à la fin de la guerre des clones. Le nouveau régime galactique instaura une dictature de la famille Saxon (qui s’était alliée à l’empire
